Gisusi sa proyekto nga EuroBlight ang nagpadayon nga pag-uswag sa patatas nga ulahi nga naguba patogen (Phytophthora infestans).
Sa 2017, hapit 1500 nga mga sample gikan sa 16 nga mga nasud sa Europe ang genotyped.
Gipakita sa mga sangputanan nga ang mga bag-ong clone nagpadayon sa pagkaylap.
Pinakabag-ong mga nahibal-an
Hapit sa 75% ang mga sampol nga nahisakop sa gihubit nga mga linya sa clonal nga naobserbahan usab sa miaging mga panahon.
Ang pila ka mga clone kaylap ug naa sa Europa kapin sa usa ka dekada, apan tulo nga mga migawas nga clone (EU_37_A2, EU_36_A2 ug EU_41) ang nagdugang sa ilang hiniusa nga frequency gikan sa 10% sa 2016 hangtod 28% sa populasyon kaniadtong 2017.
Sa parehas nga panahon, ang genotype 13_A2 mikunhod gikan sa sobra sa 30% ngadto sa dili moubos sa 20% sa populasyon.
Ang usa ka ikaupat nga bahin sa populasyon, nga nag-una gikan sa bahin sa Nordic sa Europa, nga naglangkob sa ephemeral, lainlain nga genetically isolates nga nahiuyon sa inoculum nga dala sa oospore. Ang usa ka tin-aw nga sumbanan sa rehiyon sa pagdumala sa mga clone kumpara sa mga recombinant nga sekswal ang naobserbahan sa tibuuk nga Europa.
Ang pipila nga mga implikasyon sa kini nga mga pagbakwit ug nagpadayon nga pagbag-o gihisgutan.
Pamaagi
Sukad sa pag-abut sa ikanapulo ug siyam nga siglo, ang Phytophthora infestans, ang hinungdan sa pagkaguba sa patatas, nagpabilin nga usa ka seryoso nga hulga sa paghimo sa patatas sa Europa. Bisan kung mas nasangkapan kami karon aron makontrol ang sakit kaysa kaniadto, ang mga nag-uswag nga populasyon sa pathogen nagpadayon sa paghagit sa mga integrated nga pamaagi sa pagdumala.
Ang matulin nga pagbag-o sa populasyon sa P. infestans nga hinungdan sa ulahi nga pag-ulbo sa Europa, Amerika ug Asya, lakip ang pagtumaw sa mga matang nga adunay pagdugang nga pagkaagresibo o pagkunhod sa pagkasensitibo sa fungicide, naobserbahan. Sa tinuud, ang mga pagbag-o sa populasyon nga P. infestans direkta nga nakaimpluwensya sa pag-uswag ug pagbutang sa mga resistensyado nga kultibado, paghimo sa mga sistema sa pagpasidaan sa sakit ug pagkaepektibo sa mga produkto nga proteksyon sa tanum.
(Pag-klik aron mapadako)
Ang pananglitan sa usa ka ulahing bahin sa kaso nga blight nga gilakip sa database sa Euroblight
Tungod niini, ang koordinado ug padayon nga pagmonitor sa pathogen gisugyot sa EuroBlight consortium sa tigum niini kaniadtong 2013, ug karon gipatuman ingon usa ka kalihokan sa pagmonitor sa EU, lakip ang tanan nga hingtungdan.
Nagpadayon kami sa pagmonitor sa mga populasyon ug gipili ang nagsulong nga mga genotypes aron matabangan nga ma-optimize ang mga istratehiya sa IPM, sama sa gikinahanglan sa Direktiba sa EU 2009/128 / EC sa malahutayon nga paggamit sa mga produkto sa pagpanalipod sa tanum.
Pananglitan sa us aka sample nga FTA Card. Ang FTA Card kanunay gigamit sa pagkuha ug pagpreserba sa Mga Sampol sa DNA.
Sama sa mga nangaging katuigan, ang 'FTA cards' gipanghatag sa mga 'scout' sa sakit sa tibuuk industriya, nga mibisita sa mga pananum nga naimpeksyon. Ang mga sakit nga dahon gibalhin sa mga kard ug gibalik sa mga laboratoryo diin ang pathogen DNA gi-fingerprint sa James Hutton Institute ug INRA Rennes. Ang datos sa DNA nga fingerprint nagpasabut sa mga linya sa clonal sa pathogen, ug gihiusa sa datos sa geo-location aron paglaraw sa pagkalainlain sa tibuuk nga Europa. Ang presyur sa sakit sa 2017 mas mubu kaysa kaniadtong 2016, nga gipakubusan og gamay ang frequency sa sampling ug pag-apud-apod gamay.
Hapit sa 1500 nga mga sampol ang nakolekta sa labaw sa 20 nga mga kauban sa 16 nga mga nasud sa Europa. Sama sa miaging mga tuig, ang datos sa kampanya nga AH Fight Patatas nga 'Fight Against Blight' gikan sa mga pananum sa Great Britain (GB) giapil. Kauban usab ang datos gikan sa mga kauban sa Proyekto nga IPMBlight2.0, nga naghimo usab mga datos nga phenotype sa pathogen aron suportahan ang mga estratehiya sa IPM. Ang hiniusa nga datos gikan sa 2013-2017 karon naglangkob sa kapin sa 6347 nga mga sample gikan sa 34 nga mga nasud. Uban sa suporta sa mga internasyonal nga grupo, ang datos usab gisulud alang sa mga bahin sa Asia, South America ug North Africa.
Mga nadiskobrehan
Sa miaging lima ka tuig, 60-79% sa populasyon ang naglangkob sa mga nahibal-an nga linya sa clonal nga nagbalikbalik matag panahon. Ang nahabilin nga mga sampol mga nobela, lainlaing mga genotypes nga genotypes nga kadaghanan makit-an sa usa ka lokasyon sa us aka panahon ug giapil sa usa ka kategorya nga gitawag nga 'Uban' (sa ubus).
(Pag-klik aron ma-access ang interactive database)
Ang pagmapa sa Phytophthora infestans genotypes nakit-an sa tibuuk nga Europa sa sampol sa EuroBlight sa panahon sa 2017. Pag-klik sa imahe aron ma-access ang usa ka interactive nga bersyon sa kini nga mapa. (Kortesiya: Euroblight 2018)
Sa 2017, ang clone nga EU_13_A2 (asul-13) ningbalibad gikan sa 31% sa mga sampol hangtod sa 19% nga, sa unang higayon, mas ubos kaysa sa EU_6_A1 (23%).
Ang tibuuk kalibutan nga pagpanagtag sa agresibo nga clone EU_13_A2 ug ang pagbatok niini sa metalaxyl nagpadayon nga nakaapekto sa pagkaepektibo sa pagdumala sa Europa, mga bahin sa Asia ug North Africa, nga nagpalig-on sa panginahanglan alang sa datos sa pathogen aron masuportahan ang labing kaayo nga mga pamaagi sa IPM.
Ang dalas sa EU_6_A1 makanunayon, apan kini nga clone nagpabilin nga localize sa GB, France ug usa ka sample gikan sa Belgium.
Ang kadaghan sa EU_1_A1 dugang nga mikunhod gikan sa 4.5 ngadto sa 2.2% sa populasyon, ug nakit-an sa parehas nga mga nasud sama sa EU_6_A1.
Tulo ka mga bag-ong clone ang nagbalhin sa mga genotypes sa taas ug nadugangan ang ilang range sa 2017.
- Genotype EU_36_A2 una nga gisampolan sa mga mubu nga frequency sa starch potato area sa Alemanya ug Netherlands kaniadtong 2014 ug 2015.
Kapin sa 2016 ug 2017, ang insidente niini misaka gikan sa 3.7 hangtod 8.8% sa populasyon, ug kini mikaylap sa tibuuk nga Netherlands ngadto sa Belgium, GB, Denmark ug Poland. - Genotype EU_37_A2 Una nga nakit-an sa Noordoostpolder sa Netherlands kaniadtong 2013, ug nagpabilin nga lokal sa gamay nga frequency sa 2014 ug 2015.
Nadugangan kini ngadto sa 5.5% sa populasyon nga gisampolan kaniadtong 2016, ug sa 2017 niabot og 14.4%, nga natukod usab sa Inglatera, Belhika ug amihanang Pransya. - Genotype EU_41 una nga natala sa Denmark kaniadtong 2013.
Natukod kini karon, nga naglangkob sa 4.5% sa populasyon sa 2017 ug nagkaylap sa southern Norway ug Sweden ug sa amihanang Poland sa usa ka sundanan nga nahiuyon sa airborne dispersal. Naghulat ang pagsulay sa tipo sa mating nga EU_41.
Ang pagkabuhi ug pagkaylap sa kini nga mga clone, kung ang uban mikunhod o napakyas sa pag-establisar, nagsugyot nga kini angay sa ebolusyon ug mahimong maghatag hagit sa pagpugong sa sakit.
Ang pagkunhod sa pagkasensitibo sa fluazinam kaniadto gireport sa EU_37_A2 sa Wageningen University kaniadtong 2017, nga mao ang adunay mga implikasyon sa mga pamaagi sa pagdumala. Bisan pa, wala’y magamit nga kasayuran bahin sa pagkasensitibo sa ubang mga pag-clone sa mga sangkap nga aktibo nga fungicide.
Sa katapusan, ang lainlaing genetiko nga 'Iba pa' nga mga sampol nga naglangkob sa 25% sa populasyon, ug nagpabilin sa labing kataas nga kadaghan sa silangan ug amihanan-sidlakang bahin sa Europa. Sukwahi sa pipila ka mga clone, wala pa mahibal-an ang mga kinaiya nga gipanag-iya sa 'Other' isolates ug uban pang mga clone. Bisan pa, ang Proyekto nga IPMBlight2.0 Gisugdan ang usa ka detalyado nga pagtuon sa mga kinaiya sa clonal ug sex recombinant isolates aron makatabang nga mapaayo ang ulahi nga pagdumala sa blight ug forecasting.
Ang pagkalainlain sa henetiko sa populasyon sa 2017 mahimong makita pinaagi sa paggamit sa usa ka tool sa pagtuki (poppr 2.0) nga na-link sa EuroBlight pathogen database. Ang minimum nga pagsangkad sa network (sa ubus) nagpakita sa istruktura sa populasyon sa 2017, lakip ra ang giila nga mga clone. Ang kadaghan nga pagkalainlain sa sub-clonal sulud sa 13 ka tuig ang panuigon nga EU_13_A2 na linya ang naobserbahan kung itandi sa sa mga "mas bata" nga mga clone. Ang 'ubang' mga bulag (wala gipakita) lahi sa genetiko ug gipanghatag sa tibuuk nga network. Nagpadayon ang detalyado nga pagtuki aron masusi ang pagbag-o sa populasyon gamit ang kini nga mga gamit.
(Pag-klik aron mapadako)
Ang pagkalainlain sa genetiko sa 2017 Mga infestan sa Phytophthora populasyon nga gipakita sa poppr 2.0 (minimum nga pagsangkad sa network)
Ang modelo nga EuroBlight sa pagsubay sa pathogen usa ka dali, epektibo nga gasto ug hiniusa nga pamaagi aron masabtan ang ebolusyon sa pathogen sa sukdanan sa Europa. Ang datos sa mga nagpatigbabaw nga mga clone gipasa sa mga growers, advisors, breeders ug agrochemical nga mga kompanya aron maghatag praktikal nga tambag sa pagdumala ug paghulma sa mga diskarte nga labing dugay. Naghatag ang datos usa ka sayo nga pahimangno sa insidente ug pagkaylap sa mga nobela nga clone nga makahimo sa usa ka tukma sa panahon nga tubag gikan sa industriya.
Ang network nga EuroBlight nagpadayon sa pagpahiuyon sa mga pamaagi sa ubang mga network sa Amerika ug Asya ug gidasig ang padayon nga kooperasyon sa taliwala sa mga grupo nga nalambigit sa pagdumala sa ulahi nga pag-ulbo nga pahimuslan ang database ug mga gamit alang sa pagpaayo sa pagdumala ug pagdumala sa daot sa usa ka sukod sa kalibutan.